Второе направление политических преобразований В. Путина – отстранение олигархов от власти. Формулируя свою принципиальную позицию, Президент указывал, что «так называемые олигархи… которые стали миллиардерами, как у нас говорят, в одночасье… прекрасно поняли, как можно манипулировать общественным мнением, и, по сути, так же, как поступали с природными ресурсами, начали поступать и со средствами массовой информации, и с общенациональными каналами телевидения, и так далее, подчиняя их своим групповым интересам, подменяя общенациональные интересы групповыми».
Первыми весной 2000 г. под удар были поставлены Борис Березовский и Владимир Гусинский, как и принадлежавшие им информационные империи. Генеральная прокуратура, возбудившая уголовные дела против двух олигархов, предъявила им конкретные обвинения, в первую очередь связанные с мошенничеством и преступлениями в ходе приватизации. Летом – осенью 2000 г. оба олигарха выехали из России, поставив себя в положение невозвращенцев. После этого подвластный Березовскому и самый влиятельный общероссийский телеканал ОРТ перешел под контроль государства, которое решительно поменяло его политику. Другой телеканал, НТВ, перешел под контроль подвластного государству «Газпрома», приобретшего контрольный пакет акций влиятельного СМИ. Эти меры обеспечили контроль президентской власти над самыми востребованными средствами массовой информации, быстро превратившимися в инструменты государственной пропаганды.
Летом 2003 г. Генпрокуратура возбудила несколько уголовных дел против руководителей нефтяной компании «ЮКОС» во главе с Михаилом Ходорковским. Поначалу арест Ходорковского вызвал протест со стороны ведущих организаций российского бизнеса (Российский союз промышленников и предпринимателей, «Деловая Россия» и «Опора России»), как и негативную оценку премьер-министра Михаила Михайловича Касьянова. Но после того как российский Президент потребовал от нарушивших лояльность членов правительства «прекратить истерику», а лидерам бизнеса посоветовал не вмешиваться в дела судебной власти, фронда прекратилась. Вместе с тем Президент подчеркивал, что судебное преследование олигархов вызвано грубым нарушением ими конкретных законов и что «никаких обобщений, аналогий, прецедентов, тем более связанных с итогами приватизации, не будет». Наряду с политическими изменениями на рубеже первого и второго сроков президентства В. Путина было предпринято коренное переустройство государственного аппарата – так называемая административная реформа. Идея реформы заключалась в распределении основных функций исполнительной власти: 1) разработки государственной политики и нормотворчества; 2) оказания услуг, управления государственным имуществом и правоприменения; 3) контроля и надзора – между самостоятельными органами в каждой из ключевых отраслей государстенного управления. Таким образом, предполагалось сократить число федеральных ведомств, повысить через «разделения труда» эффективность их работы и создать механизмы контроля одних ведомств над другими.
Министерства, по этой реформе, отвечали за разработку и принятие общеобязательных правил (в форме различных подзаконных актов – приказов, инструкций и т. д.) в сфере своей компетенции, федеральные агентства уполномочены эти правила применять, а также оказывать различные государственные услуги гражданам и юридическим лицам и управлять государственным имуществом, а федеральные службы контролировали исполнение этих правил (равно как и регулирующих соответствующие вопросы федеральных законов, актов президента и правительства). Например, Министерство образования и науки отвечало за выработку государственной политики и нормативно-правовое регулирование в сферах образования, научной деятельности, интеллектуальной собственности, молодежной политики. Федеральное агентство по науке и инновациям реализовывало государственную политику, управляло госимуществом и оказывало услуги в области научной, научно-технической и инновационной деятельности, а федеральное агентство по образованию – в области образования, воспитания и молодежной политики. Федеральная служба по надзору в сфере образования и науки контролировала исполнение законодательства в этой области, качество образования, выдавало лицензии и проводило аттестации учебных заведений.
Реформа с самого начала подвергалась критике за свою половинчатость и непоследовательность. В частности, хозяйственно-административные (агентства) и контрольные (службы) органы, став самостоятельными, сохранили, однако, определенную зависимость от министерств. Службы и агентства находятся в ведении соответствующих отраслевых министерств. Это означает, например, что именно министерства вносят в Правительство представление о назначении на должность руководителей служб и агентств, а в Министерство финансов – предложения по формированию их бюджета, вправе давать обязательные для исполнения поручения. С другой стороны, некоторые отрасли государственного управления были вообще оставлены за рамками реформы – прежде всего так называемые «силовые» министерства. Число министерств сократилось – с 23 до 15 (впоследствии 16), однако общее количество федеральных органов исполнительной власти (т. е. министерств, служб и агентств) – выросло почти в полтора раза, с 58 в конце 2003 г. до 85 в 2007-м. Соответственно увеличилась и численность чиновников.
Другим важным направлением административной реформы стало упорядочение работы федеральных исполнительных органов с физическими и юридическими лицами. По замыслу авторов реформы, деятельность чиновника при любом «соприкосновении» с гражданином или фирмой – будь то налогоплательщик, учредитель юридического лица, собственник недвижимости и т. д. – должна быть строго, детально регламентирована, буквально по минутам. Права и обязанности лица при обращении в государственные органы также должны быть определены максимально четко, равно как и способы защиты прав. Таким образом, предполагалось создать гарантии против коррупции и повысить эффективность и скорость работы чиновников. Новые правила вводились в форме административных регламентов, которые подробно регулировали исполнение каждой отдельной государственной функции – работу с налогоплательщиком, регистрацию эмиссии ценных бумаг и пр.
Администрация Владимира Путина продолжила много раз объявленную, но так фактически и не начатую при его предшественнике военную реформу. Российские Вооруженные силы на рубеже веков оказались в плачевном состоянии: кадровые военнослужащие страдали от невозможно низких зарплат, подлежащие призыву юноши в массовом порядке уклонялись от службы, пользуясь продажностью военных комиссариатов. Новое поколение не хотело идти в армию, опасаясь пострадать от «дедовщины» – насилия старослужащих над новобранцами – или оказаться в Чечне, и не желая «терять впустую» два года своей молодости. Катастрофически низким было снабжение армии вооружением и техникой – в войска практически не поступали самолеты и танки, а построенные в последние годы советской власти старели и выходили из строя. Знаком глубокого кризиса Вооруженных сил стала трагическая гибель в августе 2000 г. атомной подводной лодки «Курск», затонувшей в Баренцевом море в результате взрыва торпеды на борту. Весь экипаж «Курска» погиб.
В этой ситуации правительство поставило перед собой задачу, во-первых, повысить финансирование армии, обеспечить повышение зарплат, строительство жилья для военнослужащих и обновление вооружения и, во-вторых, реформировать систему комплектования Вооруженных сил. Эти задачи были выполнены лишь частично. Бюджет Министерства обороны с 2000 по 2007 г. увеличился в восемь раз, зарплаты офицеров – в три. Значительная его часть шла на финансирование операций в Чеченской Республике. Поступления новых вооружений оставались очень скромными. ВВС продолжали эксплуатировать стареющую советскую технику и довольствовались лишь небольшим числом новых и модернизированных самолетов и вертолетов. Флот за все годы первого президентства Владимира Путина (2000–2008) получил лишь одну атомную подводную лодку с крылатыми ракетами и по одному корвету, сторожевому кораблю, малому ракетному и малому артиллерийскому кораблям. За весь 2006 г. армия получила лишь 31 новый танк Т-90.
Не завершенной осталась и реформа комплектования Вооруженных сил. Полный отказ от призыва и переход к «контрактной» армии оказался невозможным. Взамен правительство приняло решение формировать из «контрактников» личный состав наиболее важных частей и подразделений – т. н. «частей постоянной готовности» сухопутных войск, ВДВ, ракетных войск, авиации и флота. Срок службы по призыву в 2007 г. был сокращен до 1 года. Одновременно были отменены многие основания для отсрочки от призыва – в том числе такие социально важные, как наличие ребенка в возрасте до 3 лет или беременность жены, а также работа сельским учителем или врачом.