оккупации Германии Макклоя и федерального канцлера Германии Аденауэра — которые, располагая безграничной поддержкой финансового капитала и созданного в Третьем рейхе рабским трудом узников концлагерей «экономического чуда» не дадут уничтожить нацизм и сделают всё возможное для реванша и нового похода на Восток.
В 1930‑е годы в качестве юриста Макклой представляет интересы семьи Рокфеллеров, основателя Федеральной резервной системы США Пола Варбурга и J.P. Morgan & Co., где его шурин Джон Цинссер (John Zinsser) тем временем стал уже членом правления.
Главной задачей Макклоя в то время было выбивание крупных денежных кредитов фашистским правительствам Германии и Италии, то есть в данном случае он уже выступал как прямой агент Гитлера и Муссолини, с которыми он встречался лично. С этой целью он целый год жил в Италии и предоставлял ссуды фашистскому режиму Бенито Муссолини. Деньги для финансирования нацистов, помимо Моргана и Рокфеллера, предоставляли DuPont de Nemours, General Motors, IBM и Ford. Многие кредиты поступали прямо на счета IG Farben, крупнейшей в мире химической и фармацевтической компании со штаб-квартирой во Франкфурте-на-Майне — главного инвестора НСДАП. К 1939 году она давала 90 % притока всей иностранной валюты и 85 % всей военной и промышленной продукции, необходимой для подготовки нацистской Германии к войне. Уже в те годы конгломерат IG Farben (BASF, Bayer, Agfa, Hoechst, включая Cassella и Chemische Fabrik Kalle, Weiler-ter-Meer и Griesheim-Elektron) широко использовали в производстве и для опытов узников концлагерей. В 1938 году в IG Farben работало 218 090 человек, к которым позднее добавились 30 000 заключённых Освенцима. Поставляемым IG Farben газом «Циклон Б» было уничтожено более миллиона узников.
В 1929 году в США была открыта дочерняя компания American IG chemical corporation, в 1939 году переименована в General anilin and film (GAF). Через неё американский банк J.P. Morgan & Co. предоставлял займы IG Farben в Германии. Принадлежащий семье Дюпонов автомобильный концерн General Motors и в годы войны активно сотрудничал с Германией, также как Ford и IBM. В их предприятия был вложен крупный капитал корпорации American IG. В свою очередь, руководство General Motors вложило в IG Farben только с 1932 по 1939 год 30 млн долларов.
Все представители IG Farben в Северной Америке были клиентами Cravath, Henderson, Leffingwell & de Gersdorff, а Макклой был связующим звеном в Европе. По существу, это была незаконная схема финансирования милитаризации Германии.
С 1931 по 1939 год Макклой расследовал один из крупнейших в истории взрывов на острове Black Tom (соседнем с островом Свободы) в Нью-Йоркской бухте (Black Tom explosion) 30 июля 1916 года, в результате которого были уничтожены подготовленные к отправке в Россию 1000 тонн оружия и боеприпасов, включая 50 тонн тротила, на сумму 20 млн долларов (510 млн долларов в ценах 2023 года). Взрыв был такой силы, что его было слышно в Филадельфии. По всему Манхэттену вылетели стёкла, зашатался Бруклинский мост. Взрывом была серьёзно повреждена статуя Свободы: факел, который статуя держит в правой руке, был закрыт для посетителей и его до сих пор не открыли.
Первоначально в ФБР решили, что имел место несчастный случай. Вскоре подозрение пало на эмигранта из Словакии Майкла Кристоффа (Michael Kristoff), который признался, что двое охранников «Чёрного Тома» были немецкими агентами. Специальные «сигарные бомбы» конструкции доктора Вальтера Шееле (Walter Scheele) им передал сотрудник посольства Германии в Вашингтоне капитан Франц фон Ринтелен (Franz Dagobert Johannes von Rintelen), который подчинялся непосредственно военному атташе посольства Германии Францу фон Папену (Franz Joseph Hermann Michael Maria von Papen, Erbsälzer zu Werl und Neuwerk).
Макклой представил доказательства того, что ответственность за взрыв несут германские тайные агенты, после чего Гаагский арбитражный суд обязал Германию выплатить 26 млн долларов в качестве компенсации за ущерб. В целях расследования Макклой в течение ряда лет путешествовал по всей Европе и встречался с нацистскими бонзами, такими как Рудольф Гесс и Герман Геринг. В итоге Макклой стал специалистом в сфере спецслужб и в 1940 году был назначен экспертом по контрразведке в военном министерстве США, а в 1941 году стал помощником военного министра Генри Льюиса Стимсона (Henry Lewis Stimson), патологического русофоба, который в своё время выступал активным противником установления дипломатических отношений между США и СССР. Стимсон осуществлял надзор за созданием американской атомной бомбы, контролируя непосредственного руководителя «Манхэттенского проекта» бригадного генерала Лесли Гровса. При выборе целей для атомной бомбардировки Японии Гровс выступал за уничтожение Киото, однако Стимсон вычеркнул Киото из списка и заменил его на Нагасаки, поскольку в своё время, в 1893 году, провёл в Киото медовый месяц с Мэйбл Веллингтон Уайт (Mabel Wellington White), праправнучкой одного из отцов-основателей США Роджера Шермана (Roger Sherman).
Макклой осуществлял связь Стимсона с Госдепом и Объединённым комитетом начальников штабов (JCS), оказывая в этом качестве влияние на внешнюю политику США и планирование большинства военно-стратегических операций, в том числе и атомных бомбардировок японских городов. Поскольку в Военном министерстве Макклой курировал работу спецслужб, именно он создал в июне 1942 года Управление стратегических служб (OSS) внутри JCS как орган для координации разведывательно-диверсионной деятельности на территории противника. OSS явилось предшественником созданного в 1947 году Центрального разведывательного управления (ЦРУ).
С 1947 по 1949 год Макклой был президентом основанного в 1946 году Всемирного банка. Он стремился создать банку репутацию на Уолл-стрит и превратить его в мощный инструмент финансовой экспансии США в Европе и оружие борьбы против коммунистического движения в мире, что ему вполне удалось.
4 апреля 1949 года для «отражения советской угрозы» был создан агрессивный блок НАТО. По словам первого генсека НАТО барона Исмея (Hastings Lionel Ismay, 1st Baron Ismay), в годы Второй мировой войны начальника личного штаба Черчилля, уже весной 1945 года подготовившего план нападения на СССР (Operation Unthinkable), целью создания НАТО было keep the Soviet Union out, the Americans in, and the Germans down («держать Советский Союз вне (Европы), американцев — внутри, а немцев — в подчинённом положении»).
23 мая 1949 года на территориях, расположенных в американской, британской и французской зонах оккупации, сепаратным путём была провозглашена Федеративная Республика Германия (ФРГ). При этом ст. 23 Основного закона ФРГ в принятой редакции, перечислявшая земли ФРГ, устанавливала, что «в остальных частях Германии он (Основной закон) должен вступить в силу по их присоединении».
2 сентября 1949 года Макклой был назначен верховным комиссаром американской зоны оккупации Германии, а уже 15 сентября 1949 года первым федеральным канцлером Германии становится его родственник Конрад Аденауэр. С этого момента на территории ФРГ начинается быстрое сворачивание всех прцессов денацификации и возвращение нацистов к власти, но уже под патронажем США и в рамках общей концепции атлантизма, превращая НАТО в Четвёртый рейх.
31 января 1951 года Макклой объявил о помиловании осуждённых в Нюрнберге военных